Έχουν περάσει 14 χρόνια από τη σχεδόν τρίτη πρόσκρουση. Ο περισσότερος κόσμος έχει αλλάξει, εκτός από τον Σίντζι Ικάρι που ξυπνάει χωρίς ηλικία σε ένα νέο και παράξενο περιβάλλον. Η Misato έχει δημιουργήσει μια ομάδα που είναι ξεχωριστή από την Nerv. Ο αγώνας δεν έχει τελειώσει ακόμα, αλλά ο μεγαλύτερος αγώνας μπορεί να είναι ενάντια στους ανθρώπους και τους πρώην συμμάχους.
To Rebuild of Evangelion ή Evangelion New Theatrical Edition, είναι μια τετραλογία ταινιών από τους δημιουργούς του Neon Genesis Evangelion, που αποτελούν reboot της αρχικής anime σειράς, με διαφορές στο σενάριο, προσθήκη νέων ηρώων και εναλλακτικό τέλος.